Rencana Pengembangan Pelabuhan
Program Investasi yang akan dilaksanakan pada tahun 2013, secara garis besar meliputi :
Revitalisasi Terminal Penumpang Kalimas
Sebagai bagian dari program penataan pelabuhan Tanjung Perak, dilakukan pengembangan Terminal Penumpang Kalimas. Rencana Pembangunan Terminal Penumpang tersebut dilakukan di area seluas 13Ha, yang nantinya terdapat Terminal Penumpang, Gedung Heritage, Pusat Bisnis, Pusat Perbelanjaan, Terminal Ferry, dan Terminal Bis.
Pengembangan Pelabuhan Banjarmasin
Dalam rangka meningkatkan kapasitas di Cabang Pelabuhan Banjarmasin, Pelindo III menambah fasilitas Terminal Petikemas Banjarmasin dengan membangun Terminal baru seluas 300Ha di kawasan Mantuil. Yang direncanakan akan digunakan untuk menangani General Cargo, Curah Kering, Curah Cair, Terminal Penumpang, & Terminal Mobil.
Pengembangan Pelabuhan Lembar
Dalam proses penataan dan pengembangan di Cabang Pelabuhan Lembar, PELINDO III berencana mengembangan Pelabuhan Baru di Wilayah Teluk Waru (NTB). Rencana pembangunan di area seluas 21,22Ha yang direncanakan digunakan untuk Terminal Petikemas, Terminal General Cargo, Terminal Penumpang.